在分子生物学和医学研究领域,福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本被视为珍贵的生物资源,蕴藏着丰富的历史样本及临床信息。然而,由于在固定和存储过程中,DNA可能会遭受降解、交联和片段化等问题,FFPE样本在二代测序(NGS)分析中成为了一大技术瓶颈。因此,如何从FFPE样本中提取出合格的DNA并建立高质量的文库,成为了当前测序研究中的紧迫课题。
什么是FFPE样本
FFPE样本是通过福尔马林固定石蜡包埋(Formalin-Fixed, Paraffin-Embedded)技术处理和保存的生物组织样本。这种方法能够有效地延长组织标本的保存时间,且便于运输,因此被广泛应用于病理学、组织学和分子生物学研究,尤其是在癌症和遗传学领域,是研究历史样本和临床样本的重要来源。
FFPE样本的应用
通过福尔马林固定,FFPE样本能够有效保存组织结构和细胞形态,同时通过石蜡包埋提供了长期保存的条件。这些样本不仅具有高度的可存档性和临床应用价值,还能跨越数年的保存时间,使得回顾性研究变得可行。总体而言,FFPE样本是贯穿临床病理数据与分子层面研究的重要桥梁,特别适用于需要从大量历史临床样本中获取基因组信息的研究项目。
FFPE样本的特点
FFPE组织切片被视为生物医学研究中的“瑰宝”,潜藏着丰富的疾病信息,为临床诊断和科学研究提供了重要支持。然而,FFPE样本的制作过程既提供了许多优势,也带来了相应的挑战。
高质量建库的关键:修复
从FFPE样本中提取临床材料是一种普遍而有效的方法,但固定和保存过程中可能会对样本中的核酸质量造成损伤,影响其完整性。因此,提取出高质量的序列数据变得十分具有挑战性,尤其是在样本量有限的情况下。尊龙凯时推出的FFPE修复试剂(HieffNGS® FFPE DNA Repair Reagent, Cat#12606ES),经过多种酶的特定配方优化而成,经过验证能够有效修复FFPE样本中的DNA。该修复试剂不仅提高了文库获得量,还有助于提升建库的成功率,显示出无偏嗜性的特点。
修复试剂的效果
在文库构建过程中,通过设置两组对照实验,比较相同样本在添加与不添加修复试剂下的情况。实验结果表明,FFPE修复试剂显著提高了低质量FFPE样本的文库产出,而对高质量样本的文库提升效果则相对较少。经过在不同温度下的稳定性测试,结果显示在4℃和25℃条件下,修复试剂在四周后文库产量与对照组相比几乎无明显下降趋势。
FFPE样本承载着大量宝贵的临床与科研数据。通过尊龙凯时的FFPE样本修复试剂,研究人员可以充分挖掘这些样本的潜能,将被“沉睡”的数据转化为推动医学进步的重要资源。无论您专注于肿瘤基因组研究、遗传学分析,还是历史样本的解读,我们的FFPE修复试剂都能为您的研究提供有力支持。让每一个样本都能够展现其独特的价值,助力科研探索!
产品选择指南
- 产品名称: MolPure® Magnetic FFPE DNA Kit - 磁珠法石蜡包埋组织DNA提取试剂盒(瓶装)
- 产品编号: V218375ES - FFPE DNA提取
- 产品名称: HieffNGS® FFPE DNA Repair Reagent - FFPE DNA样本修复试剂
- 产品编号: 12606ES - FFPE DNA修复试剂
- 产品名称: HieffNGS® DNA Library Prep Kit - 20全能型DNA建库试剂盒
- 产品编号: 2012927ES - 机械法建库
- 产品名称: HieffNGS® One Pot Pro DNA Library Prep Kit V3 - 一步法DNA建库试剂盒
- 产品编号: V312194ES - 酶切法建库